Salah satu program unggulan MI Unggulan Sabilillah Lamongan adalah hafalan doa-doa harian, kegiatan ini dilaksanakan setiap hari sebelum pelajaran dimulai dan dibaca secara lantang oleh semua siswa sedangkan ustadz-ustadzah yang memandu. Adapun doa-doa harian meliputi; Do’a sebelum belajar, do’a sebelum makan, do’a setelah makan, masuk kamar mandi, keluar kamar mandi, setelah wudlu, setelah adzan, penutup majlis, do’a memohon ampunan untuk diri sendiri dan orang tua. Do’a memakai pakaian, do’a membuka pakaian, do’a ketika bercermin, do’a masuk rumah, do’a keluar rumah, do’a masuk masjid, do’a keluar masjid, do’a mohon pertolongan, do’a dilapangkan dada dan dimudahkan dalam urusan, do’a naik kendaraan. Do’a mohon diberi keselamatan, do’a mohon selamat dunia akherat, do’a ketika lupa, do’a mohon diberi kecerdasan dalam berpikir, do’a ketika hujan turun, do’a setelah hujan, do’a ketika ada petir, do’a ketika sakit, do’a menjenguk orang sakit. Do’a aman dari fakir dan siksa kubur, do’a mohon diberi kemudahan dalam bekerja dan berfikir, do’a kesehatan fisik, do’a ketika menerima sedekah, do’a ketika pindah rumah, do’a menjelang pagi, do’a menjelang sore, do’a menjelang malam, do’a mohon penjagaan siang dan malam. Adapun tujuan dari kegiatan ini adalah agar siswa-siswi terbiasa dengan doa-doa harian sehingga akan menghasilkan peserta didik yang islami dan berkualitas dalam beribadah.